สำนักงานเกษตรจังหวัดสงขลาเป็นหน่วยงานส่งเสริมการเกษตรในส่วนภูมิภาค ภายใต้การบริหารงานของกรมส่งเสริมการเกษตร กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ แบ่งการบริหารงานเป็น 1 ฝ่าย 4 กลุ่ม ดังนี้
- ฝ่ายบริหารทั่วไป
- กลุ่มยุทธศาสตร์และสารสนเทศ
- กลุ่มส่งเสริมและพัฒนาการผลิต
- กลุ่มส่งเสริมและพัฒนาเกษตรกร
- กลุ่มอารักขาพืช
มีหน่วยงานสำนักงานเกษตรอำเภอ 16 อำเภอภายใต้การบริหารงานของสำนักงานเกษตรจังหวัดสงขลา
